Đầu tiên, NADH peroxidase giúp loại bỏ hydro peroxit có khả năng gây hại đến tế bào trong điều kiện sinh trưởng hiếu khí và cũng như bảo vệ chống lại stress oxy hóa qua H2O2. Thứ hai, enzyme thể hiện một cơ chế bổ sung để tái tạo NAD+ cần thiết cho quá trình chuyển hóa lên men nghiêm ngặt của sinh vật. Ngoài ra, enzyme này cũng có thể bảo vệ trước H2O2 ngoại sinh và góp phần vào độc lực của vi khuẩn.[2][3]

Chức năng thực tế của NADH peroxidase và oxidase trong thực vật vẫn chưa rõ ràng, nhưng chúng có liên quan đến stress oxy hóa thông qua việc tạo ra H2O2.[4]

Một chức năng khác có thể có của NADH peroxidase là giúp điều hòa sự hình thành H2O2 trong việc nới lỏng và tái cấu trúc thành tế bào.[5]